环境微生物技术受世界各国重视早在2002年联合国环境规划署就发出了警告，全球环境状况在过去30年中持续恶化，国际社会如不迅速采取有效措施，人类未来的生存与发展将会面临巨大威胁。
针对这一问题，世界各国都积极采取措施治理环境污染，而微生物技术在处理环境污染物方面具有速度快、效率高、消耗低、成本低、反应条件温和，以及无二次污染等显著优点，受到了各国政府的高度重视。美国是世界上生物技术最发达的国家，其与环境有关的生物技术占生物技术总投资的50%以上。2002年，美国能源部（DOE）斥巨资启动了“由基因组到生命”的系统生物学技术平台，该技术平台的重要目标之一是服务于二氧化碳隔离、环境生物整治和生物能源的研究和开发。日本也在2007年提出了“国家生物资源计划”，并投入32亿日元。其目标就是确保优势研究领域的生物资源，科学评价生物资源的质量和数量；建立菌株、群落、组织、细胞、基因材料，以及动植物与微生物信息等战略生物资源。生化培养箱,霉菌培养箱对我国环境微生物菌种做出巨大贡献。
微生物环保产业潜力巨大环境污染给世界造成了巨大的经济损失，也带来了无限的产业商机。据有关资料统计，全球环保产业市场容量大约是8000亿美元。面对如此庞大和潜力无限的环保产业，大型跨国公司不惜重金积极研发环保技术产品，以期抢占更多的市场份额。
2003年年底发生在西班牙海域的“威望号”油轮断裂事件导致7.7万桶燃油泄漏，仅西班牙一国为其清理污染就已耗资10亿美元。石油泄漏处理公司研制的多种强降解能力的商品微生物制剂，制造成干粉末状，使用时溶于水中或直接播撒在石油污染物表面，以去除石油污染。另外，通过投入优良菌种或注入营养物到油藏从而提高石油采收率的微生物采油技术，已经在世界上获得极大的成功。
微生物是自然界最重要的污染物分解者，发现新的污染降解微生物资源、污染物降解途径和代谢过程等，可以有效促进环保产业的发展。利用资源环境微生物技术还可以进行环境友好产品的生产、进行难降解化合物污染的处理和生物修复等。
由此可见，环境微生物技术的发展和成长才刚刚开始，但已经渗入了现代生产生活的各个环节，在重工业、日用消费品工业、石油产业、运输产业、农业、渔业、食品产业、污水及其他污染物处理等产业应用中产生了深远的影响。