随着社会的快速发展，人们对于生态环境的保护也更加重视，但是在农业种植中，一些化肥等作物助剂的使用对土壤、水质等造成了不好的影响。复合微生物菌剂就很好的解决了这些问题，对于环境保护有着十分重要的作用。
我们平常使用的化肥等生物助剂中含有丰富的氮磷等营养成分，当这些成分在合适的阳光、温度等条件诱导下，低等藻类等生物就会大量繁殖，阻碍水体复氧，产生富营养化现象。水体、土壤的过度营养化需要消耗大量的溶解氧分解有机物，就会导致水体缺氧，进而对生物和作物的生长造成影响。利用复合微生物菌剂能够达到较好的生态系统平衡，它里面的菌群可降解污染物，保护土壤环境。