诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒的应用及操作流程!
小杨 / 2023-11-27 09:00:32


一、背景

诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒是一种专门用于检测诺氏梭状芽孢杆菌的体外诊断试剂。它采用了聚合酶链式反应(PCR)技术,能够在短时间内快速、准确地检测出诺氏梭状芽孢杆菌。

诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒的主要成分包括PCR反应液、DNA模板、引物、酶等。其中,PCR反应液是PCR反应的基础,包含PCR反应所需的各种成分,如缓冲液、离子、酶等。DNA模板是含有诺氏梭状芽孢杆菌特异性基因序列的DNA片段,用于扩增出特异性片段。引物是一段与DNA模板特异性结合的短序列,用于启动PCR反应。酶是热稳定的DNA聚合酶,用于催化DNA合成。

使用诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒时,需要将DNA模板、引物和PCR反应液混合后进行PCR反应。在适宜的温度和条件下,引物与DNA模板特异性结合,并通过酶的催化进行DNA合成,最终得到大量的特异性DNA片段。通过凝胶电泳等技术对这些片段进行检测和分析,可以确定是否存在诺氏梭状芽孢杆菌。

二、诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒操作流程

1、整个检测过程应严格按照本说明书要求分别在试剂准备区、样本处理区和PCR扩增区进行操作,各区实验服、仪器、耗材应独立使用,不能混用;实验用吸头采用带滤芯吸头;样本处理区应配有生物安全柜,样本处理在生物安全柜中进行操作;三个区应该配有紫外线杀菌装置。

2、为避免RNA降解,样本处理过程应在0-4℃条件下操作,且完成实验后立即上机检测;样本处理过程中使用的器具耗材应经过无核酶处理。

3、每次实验应该设置阴、阳性对照。

4、试剂盒所有试剂在使用前应该在常温下充分融化混匀,并应瞬时离心。

5、试剂盒内所配阴性和阳性对照在一次使用前应全部转移至标本准备区,并单独存放。

6、为防止荧光干扰,应避免裸手直接接触PCR反应管,并应避免在PCR反应管上进行任何标记。

7、仪器扩增相关参数应按照本说明书相关要求进行设置;不同批号试剂不能混用。

8、ABI系列荧光定量PCR仪参数设置中不选ROX校正,淬灭基因选择None。

9、实验过程中产品的废弃物应该进行无害化处理后方可丢弃。

三、应用

诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒可以用于诺氏梭菌孢子联合化疗治疗裸鼠移植肝癌的实验研究:

诺氏梭菌孢子(C.novyi-NT)在体外对人肝癌细胞HuH-7细胞系的毒性作用及对血管内皮生长因子(VEGF)表达的影响

研究在体外厌氧条件下,诺氏梭菌孢子(C.novyi-NT)对体外培养的人肝癌细胞HuH-7细胞系的毒性作用及其对VEGF表达与分泌的影响。

材料与方法:采用诺氏梭状芽孢杆菌PCR试剂盒筛选诺氏梭菌菌落收集梭菌孢子;采用细胞培养技术,以人肝癌细胞HuH-7细胞系为靶细胞,将HuH-7细胞随机分成对照组、梭菌孢子组及阿霉素组,厌氧培养条件下分别加入磷酸盐缓冲液(PBS液)、诺氏梭菌孢子C.novyi-NT及阿霉素。处理12小时、24小时、48小时及72小时后,应用WST-1比色法测定各不同处理方法对人肝癌细胞HuH-7细胞系的毒性(0D值)。

应用酶联免疫吸附试验(ELISA法)测定反应24小时、48小时及72小时后对照组及梭菌孢子组细胞培养基上清液中血管内皮生长因子(VEGF)蛋白含量。应用反转录聚合酶链反应法(RT-PCR法)分析厌氧培养72小时后对照组及梭菌孢子组HuH-7细胞的VEGF mRNA表达水平。

结果:将梭菌孢子C.novyi-NT加入体外培养的人肝癌细胞HuH-7细胞后显示出毒性作用和对该细胞系的生长抑制效应。加入梭菌孢子C.novyi-NT作用12小时后,细胞生长开始出现停滞,细胞呈圆形或球形,胞浆中出现颗粒状物质。72小时后,细胞培养基中出现更多细胞碎片。

厌氧培养条件下,细胞损伤随时间的延长逐渐加剧。24小时后,梭菌孢子C.novyi-NT的细胞毒性作用明显强于对照组,两组0D值具有显著差异,与阿霉素组相比无明显差异。24、48、72小时细胞上清液中VEGF的量,梭菌孢子组与对照组相比无明显统计学差异;但72小时后,梭菌孢子组厌氧培养的细胞VEGF mRNA表达水平明显高于对照组(p=0.012)。

结论:在厌氧培养条件下诺氏梭菌孢子(C.novyi-NT)对体外培养的人肝癌细胞HuH-7细胞系有明显的细胞毒性作用,且影响VEGF的mRNA表达。

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