菌种属于活的生物制品，采用简易征收率为3%。
相关政策：
1、《中华人民共和国增值税暂行条例》第二条 增值税税率：
（一）纳税人销售或者进口货物，除本条第（二）项、第（三）项规定外，税率为17%。
（二）纳税人销售或者进口下列货物，税率为13%：
1.粮食、食用植物油；
2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品；
3.图书、报纸、杂志；
4.饲料、化肥、农药、农机、农膜；
5.国务院规定的其他货物。
（三）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。
（四）纳税人提供加工、修理修配劳务（以下称应税劳务），税率为17%。
2,，根据《财政部 国家税务总局关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知》（财税〔2009〕9号）
规定：1、下列按简易办法征收增值税的优惠政策继续执行，不得抵扣进项税额：
2，一般纳税人销售自产的下列货物，可选择按照简易办法依照6%征收率（调整为“依照3%征收率”）计算缴纳增值税：
3，用微生物、微生物代谢产物、动物毒素、人或动物的血液或组织制成的生物制品。 根据《财政部 国家税务总局关于简并增值税征收率政策的通知》（财税（2014）57号）规定：二、财税〔2009〕9号文件第二条第（三）项和第三条“依照6%征收率”调整为“依照3%征收率”。
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